Взаимодействие между метилирането на ДНК и некодиращите РНК при топлинен стрес на Arabidopsis thaliana и Cicer arietinum, Акроним: EPIHEAT

Основна информация

Описание

Климатичните промени и повишаването на температурите представляват сериозно предизвикателство за растителната продуктивност. Сред ключовите механизми за адаптация към топлинен стрес е епигенетичната регулация, която включва и динамичните промени в ДНК метилирането и действието на некодиращите РНК (ncRNA). Все повече данни показват, че ncRNA участват не само в посттранскрипционния контрол на генната експресия, но и в насочването на епигенетични модификации чрез механизма RNA-directed DNA methylation (RdDM). Въпреки това взаимодействието между ncRNA и ДНК метилирането при топлинен стрес остава недостатъчно изяснено.
Проектът изследва хипотезата, че специфични транспозон-асоциирани ncRNA локуси, поддържани в транскрипционно заглушено състояние чрез ДНК метилиране при нормални условия, се активират при топлинен стрес вследствие на локус-специфични промени в метилирането. Целта е да се определи ролята на това епигенетично препрограмиране в координирането на стресовия отговор.
За проверка на хипотезата ще бъде приложен интегративен подход при Arabidopsis thaliana и Cicer arietinum. Чрез бисулфитно секвениране на целия геном (WGBS) ще бъдат идентифицирани диференциално метилирани региони, които ще бъдат интегрирани с профили на малки и дълги некодиращи РНК при контролни и стресови условия. Специално внимание ще бъде отделено на TE-асоциирани ncRNA локуси, включително кандидати, идентифицирани в предходни изследвания на екипа.
Очакваните резултати включват идентифициране на метилационно-чувствителни ncRNA, разкриване на регулаторни мрежи, свързващи ДНК метилирането, ncRNA и генната експресия, както и определяне на консервативни и видово-специфични механизми на адаптация към топлинен стрес при двата вида. Проектът е в съответствие с целите на COST акцията EPICROPS и ще допринесе за международното сътрудничество, обмена на знания и обучението на млади учени в областта на епигеномиката и интегративния анализ на omics данни.

В публичния набор няма свързани договори за този проект.

Изпълнителят се свързва чрез официалното поле EntityId от договора към секцията Entities. Когато един официален номер съдържа няколко договорни реда, всеки ред се запазва отделно.

Финансиране